产品货号:
RFT036
中文名称:
土壤基因组DNA提取试剂盒
英文名称:
Soil genomic DNA Extraction Kit
产品规格:
50次
发货周期:
1~3天
产品价格:
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本公司的土壤DNA提取试剂盒采用独特的腐殖酸去除液(缓冲液R2)能够有效去除腐殖酸;吸附柱CG能能有效去除金属等抑制因子,提纯得到的基因组DNA可直接用于PCR反应,酶切或定量实验。
试剂盒组份:
准备工作:
1.准备55℃,70℃水浴;无水乙醇;异丙醇;制冰机;1.5ml离心管;2ml离心管
2.按照标签所示在漂洗缓冲液WB2中加入无水乙醇,混匀后盖紧瓶盖后室温贮存备用。
3.每次使用前请检查缓冲液R2,缓冲液R3是否有沉淀生成,如果出现沉淀,37℃温浴至沉淀溶解后再使用。
标准操作步骤:
如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
1、称0.3-0.5g土壤置于2ml离心管中,加入0.4g Glass Beads,再加入780μl缓冲液R1与100μl缓冲液R2。涡旋器高速震荡3-5min。
注:对含水量丰富的样品,可以预先离心除去部分水分后再称取样品。缓冲液R2是腐殖酸去除剂,100μl对大部分样品来说足以有效除去腐殖酸等抑制因子。对一些腐殖酸含量特别丰富的土壤,缓冲液R2的量可以适当增加,但不能超过250μl,否则会严重影响DNA的得率。
2、加入200μl缓冲液R3(R3如有沉淀37℃水浴完全溶解后再用),涡旋混匀。70℃水浴处理10min。期间振荡几次。
注:如果要纯化革兰氏阳性菌的DNA,请在70℃处理完后,再90℃水浴处理2min。
3、12000rpm(~13000g)离心1分钟,取600μl上清到1.5ml离心管中,加入180μl缓冲液R4混匀。
注:转移上清时确保不要吸取到沉淀,转移的上清量最好不超过80%。
4、冰上放置5分钟。12000rpm(~13000g)离心1分钟。转移上清到新的1.5ml离心管中。
注:转移上清时确保不要吸取到沉淀,转移的上清量最好不超过80%。
5、加入0.7倍上清体积的异丙醇颠倒混匀。12000rpm(~13000g)离心2分钟。小心地倒掉上清。
注:如果样品中DNA含量很低,加入异丙醇混匀后-20℃放置1小时。
6、加入350μl缓冲液R5,待沉淀完全溶解后加入300μl无水乙醇,混匀。
注:为加速溶解沉淀,可置样品于55℃水浴中。
7、将上步混合液转移到吸附柱CG中(吸附柱放入收集管中),12000rpm离心30秒,倒掉滤过液。
8、向吸附柱CG中加入500μl漂洗缓冲液WB1,12,000rpm (~13,000×g)离心30秒,倒掉废液。
9、向吸附柱CG中加入600μl漂洗缓冲液WB2(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm (~13000g)离心30秒,倒掉废液,吸附柱CG放入收集管中。
10、向吸附柱CG中加入600μl漂洗缓冲液WB2,12,000rpm (~13000g)离心30秒,倒掉废液,将吸附柱CG放入收集管中。
11、12,000rpm(~13000g)离心2分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注:此步骤非常重要,其目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
12、将吸附柱CG转入一个干净的1.5ml离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50–100μl经70℃水浴预热的洗脱缓冲液EB,室温放置2分钟,12,000rpm(~13000g)离心2分钟。
注意:
a.洗脱缓冲液体积最好不少于50μl,体积过小影响回收效率。
b.洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。
13、DNA产物-20℃保存。
大量操作步骤(针对含微量核酸的样品)
1、称1-5g土壤置于10ml离心管中,加入1g Glass Beads,再加入3ml缓冲液R1与200μl缓冲液R2。涡旋器高速震荡3-5分钟。
2、加入600μl缓冲液R3,涡旋混匀。70℃水浴处理10分钟。期间振荡几次。
3、3000g离心3分钟,转移上清到新的离心管中,加入550μl缓冲液R4混匀。
4、冰上放置5分钟。8000g离心10分钟。转移上清到新的离心管中。
5、以下按标准操作步骤的第五步继续操作。
DNA浓度及纯度检测:
基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。提取的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。可配制0.8-1.0%琼脂糖凝胶,使用λ/HindIII判断基因组的大小,完整的基因组大小应在23kb以上。使用分光光度计检测时,OD260/OD280比值应为1.7–1.9之间,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水洗脱,比值可能偏低,但并不表明DNA纯度不高。
常见问题分析:
储存条件:室温,有效期12个月。
相关搜索:土壤基因组DNA提取试剂盒,Soil genomic DNA Extraction Kit
试剂盒组份:
试剂盒组成 | 50次 | 贮存方式 |
缓冲液R1 | 40ml | 常温 |
缓冲液R2 | 6ml | 常温 |
缓冲液R3 | 6ml | 常温 |
缓冲液R4 | 10ml | 常温 |
缓冲液R5 | 20ml | 常温 |
漂洗缓冲液WB1 | 30ml | 常温 |
漂洗缓冲液WB2 (浓缩液) | 13ml | 室温 |
洗脱缓冲液EB | 15ml | 室温 |
Glass beads | 20g | 常温 |
吸附柱CG | 50个 | 室温 |
收集管(2ml) | 50个 | 室温 |
说明书 | 1份 |
准备工作:
1.准备55℃,70℃水浴;无水乙醇;异丙醇;制冰机;1.5ml离心管;2ml离心管
2.按照标签所示在漂洗缓冲液WB2中加入无水乙醇,混匀后盖紧瓶盖后室温贮存备用。
3.每次使用前请检查缓冲液R2,缓冲液R3是否有沉淀生成,如果出现沉淀,37℃温浴至沉淀溶解后再使用。
标准操作步骤:
如非指出,所有离心步骤均为使用台式离心机在室温下离心。
1、称0.3-0.5g土壤置于2ml离心管中,加入0.4g Glass Beads,再加入780μl缓冲液R1与100μl缓冲液R2。涡旋器高速震荡3-5min。
注:对含水量丰富的样品,可以预先离心除去部分水分后再称取样品。缓冲液R2是腐殖酸去除剂,100μl对大部分样品来说足以有效除去腐殖酸等抑制因子。对一些腐殖酸含量特别丰富的土壤,缓冲液R2的量可以适当增加,但不能超过250μl,否则会严重影响DNA的得率。
2、加入200μl缓冲液R3(R3如有沉淀37℃水浴完全溶解后再用),涡旋混匀。70℃水浴处理10min。期间振荡几次。
注:如果要纯化革兰氏阳性菌的DNA,请在70℃处理完后,再90℃水浴处理2min。
3、12000rpm(~13000g)离心1分钟,取600μl上清到1.5ml离心管中,加入180μl缓冲液R4混匀。
注:转移上清时确保不要吸取到沉淀,转移的上清量最好不超过80%。
4、冰上放置5分钟。12000rpm(~13000g)离心1分钟。转移上清到新的1.5ml离心管中。
注:转移上清时确保不要吸取到沉淀,转移的上清量最好不超过80%。
5、加入0.7倍上清体积的异丙醇颠倒混匀。12000rpm(~13000g)离心2分钟。小心地倒掉上清。
注:如果样品中DNA含量很低,加入异丙醇混匀后-20℃放置1小时。
6、加入350μl缓冲液R5,待沉淀完全溶解后加入300μl无水乙醇,混匀。
注:为加速溶解沉淀,可置样品于55℃水浴中。
7、将上步混合液转移到吸附柱CG中(吸附柱放入收集管中),12000rpm离心30秒,倒掉滤过液。
8、向吸附柱CG中加入500μl漂洗缓冲液WB1,12,000rpm (~13,000×g)离心30秒,倒掉废液。
9、向吸附柱CG中加入600μl漂洗缓冲液WB2(使用前请先检查是否已加入无水乙醇),12,000rpm (~13000g)离心30秒,倒掉废液,吸附柱CG放入收集管中。
10、向吸附柱CG中加入600μl漂洗缓冲液WB2,12,000rpm (~13000g)离心30秒,倒掉废液,将吸附柱CG放入收集管中。
11、12,000rpm(~13000g)离心2分钟,以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液。
注:此步骤非常重要,其目的是将吸附柱中残余的漂洗液去除。漂洗液中乙醇的残留会影响后续的酶反应(酶切、PCR等)实验。
12、将吸附柱CG转入一个干净的1.5ml离心管中,向吸附膜的中间部位悬空滴加50–100μl经70℃水浴预热的洗脱缓冲液EB,室温放置2分钟,12,000rpm(~13000g)离心2分钟。
注意:
a.洗脱缓冲液体积最好不少于50μl,体积过小影响回收效率。
b.洗脱液的pH值对于洗脱效率有很大影响。若用水做洗脱液应保证其pH值在7.0-8.5范围内,pH值低于7.0会降低洗脱效率。
13、DNA产物-20℃保存。
大量操作步骤(针对含微量核酸的样品)
1、称1-5g土壤置于10ml离心管中,加入1g Glass Beads,再加入3ml缓冲液R1与200μl缓冲液R2。涡旋器高速震荡3-5分钟。
2、加入600μl缓冲液R3,涡旋混匀。70℃水浴处理10分钟。期间振荡几次。
3、3000g离心3分钟,转移上清到新的离心管中,加入550μl缓冲液R4混匀。
4、冰上放置5分钟。8000g离心10分钟。转移上清到新的离心管中。
5、以下按标准操作步骤的第五步继续操作。
DNA浓度及纯度检测:
基因组DNA片段的大小与样品保存时间、操作过程中的剪切力等因素有关。提取的DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。可配制0.8-1.0%琼脂糖凝胶,使用λ/HindIII判断基因组的大小,完整的基因组大小应在23kb以上。使用分光光度计检测时,OD260/OD280比值应为1.7–1.9之间,如果洗脱时不使用洗脱缓冲液,而使用去离子水洗脱,比值可能偏低,但并不表明DNA纯度不高。
常见问题分析:
常见问题 | 可能原因 | 建议 |
没有洗脱出DNA | 加入缓冲液R5后没有加入无水乙醇 | 样品过柱前,必须用无水乙醇调整核酸结合条件,否则核酸不能挂柱。 |
漂洗缓冲液WB2中没有加入乙醇 | 漂洗缓冲液WB2使用前请按照标签加入无水乙醇。无水乙醇加入量不正确会导致核酸提取量大大降低。 | |
低浓度的DNA量 | 缓冲液R2使用过量 | 按照步骤1加入适量缓冲液R2 |
洗脱体积太小 | 洗脱体积不能低于50μl,如洗脱体积太小,回收率将大大降低。 | |
洗涤不恰当 | 漂洗缓冲液WB2使用前请按照标签加入无水乙醇。无水乙醇加入量不正确会导致核酸提取量大大降低。 | |
低A260/A280比率 | 蛋白污染 | 不要忽略步骤8中用漂洗缓冲液WB1冲洗吸附柱 |
洗脱液pH值不合适 | 确保使用的洗脱液pH在8.0以上,如低于8.0将导致DNA洗脱量过低。 | |
下游应用不好 | 提取的DNA含盐量高 | 漂洗缓冲液WB2使用前请按照标签加入无水乙醇。 |
提取的DNA含有乙醇 | 步骤11空甩柱子2分钟非常关键,彻底去除漂洗液中的乙醇。 | |
抑制PCR反应 | 增加缓冲液R2用量,彻底去除腐殖酸等PCR抑制因子;步骤4中确保不要吸取到沉淀。 |
储存条件:室温,有效期12个月。
相关搜索:土壤基因组DNA提取试剂盒,Soil genomic DNA Extraction Kit